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1、冷凍干燥在低溫下進行因而對于許多熱敏性的物質特別適用。如蛋白質、微生物之類不會產生變性或失掉生物生機。因而冷凍干燥機在醫藥上得到廣泛地應用。
2、因為在凍住的狀態下進行干燥因而體積簡直不變保持了本來的結構不會產生濃縮現象。

3、冷凍干燥機干燥后的物質疏松多孔呈海綿狀加水后溶解迅速而徹底簡直當即康復本來的性狀。

4、因為冷凍干燥機干燥在真空下進行氧氣很少因而一些易氧化的物質得到了保護。

5、冷凍干燥機在低溫下干燥時物質中的一些揮發性成分損失很小合適一些化學產品藥品和食品干燥。

6、在冷凍干燥過程中微生物的成長和酶的效果無法進行因而能保持本來的性裝。

7、冷凍干燥機干燥能掃除95-99%以上的水份使干燥后產品能長時間保存而不致變質。

8、因為物猜中水分在預凍以后以冰晶的形狀存在，本來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中。

9、冷凍干燥機干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而徹底，簡直當即康復本來的性狀。

10、因為干燥在真空下進行，氧氣很少，因而一些易氧化的物質進行干燥得到了保護。